Iraneren Mohammad Fazlhashemi har siden 2013 vært Sveriges første professor i islamsk teologi og filosofi. Professoratet ble opprettet i 2013 og muliggjort gjennom en donasjon fra den svenske regjeringen, samt direkte finansiering fra den tyrkiske staten via myndigheten Diyanet.
Samarbeidet og finansieringen av professoratet ble offentlig kjent da den tyrkiske presidenten Abdullah Gül avla statsbesøk i Sverige i mars 2013. Diyanet er Tyrkias statlige myndighet for religiøse spørsmål. Myndigheten administrerer og fører tilsyn med moskeer i Tyrkia, utdanner og lønner imamer, utsteder religiøse fatwaer og organiserer pilegrimsreiser til Mekka og Medina.
Diyanet finansierer moskeer, imamer og teologiske satsinger også utenfor Tyrkia – blant annet i Sverige og ellers i Europa. Under regjeringspartiet AKP og president Recep Tayyip Erdoğan har Diyanets budsjett, bemanning og politiske innflytelse vokst kraftig. Dette har ført til spørsmål både i og utenfor Tyrkia om myndighetens stadig større rolle i landets utenrikspolitikk.
Den tyrkiske staten, gjennom Diyanet, eier og driver flere moskeer rundt om i Sverige, blant annet i Fittja i Botkyrka og i Rinkeby. Virksomheten i Sverige ledes av en religiøs rådgiver som er stasjonert ved den tyrkiske ambassaden i Stockholm.
Ni svenske moskeer har imamer som er utsendt og lønnet av den tyrkiske staten, avslørte Dagens Nyheter i april 2017.
Ifølge avisen inngår det i imamens oppgaver å rapportere personer som er kritiske til regimet.
Emin Poljarevic er dosent i islamsk teologi og filosofi ved Det teologiske fakultet ved Uppsala universitet. I 2021 bidro han, sammen med Anna Ardin og Mattias Irving (tidligere styremedlemmer i Socialdemokrater för tro och solidaritet), til en antologi om islamofobi i Europa utgitt av den tyrkisk-regimetro tenketanken SETA.
I mai 2018 skrev Mattias Gardell, professor og vitenskapelig leder ved CEMFOR (Centrum för mångvetenskaplig forskning om rasism) ved Uppsala universitet, et bidrag til den samme antologien. Tyrkias utenriksminister Mevlüt Çavuşoğlu var hovedtaler da antologien ble presentert. På 30 av antologiens 64 sider anklaget Mattias Gardell Sveriges riksdagspartier for islamofobi. Også SETAs rapport fra 2021 ble utarbeidet med blant annet støtte fra CEMFOR ved Uppsala universitet.
I likhet med Tyrkias president Erdoğan hevder Mattias Gardell at Hamas ikke er en terrorgruppe.
Gardell hadde en sentral rolle i den første Ship to Gaza-konvoien i 2010, der den tyrkiske organisasjonen IHH deltok i forberedelsene. IHH har nære forbindelser til den tyrkiske regjeringen og president Erdoğan, og har historisk støttet Det muslimske brorskapet og Hamas. Tyskland forbød IHHs tyske avdeling i 2010.
Ifølge terrorforskeren Magnus Ranstorp har IHH nære forbindelser til terrorgrupper som al-Qaida og Hamas. Muhammad Sawalha, en høytstående person i Hamas og Det muslimske brorskapet, var ifølge både Sawalha selv og TV-kanalen Al Jazeeras omtale en av dem som organiserte konvoien.
I mars 2018 skrev Svenska komiteen mot antisemitttitsme (SKMA) at Gardell skulle dele talerstol i Tyrkia med to personer som hadde kommet med rasistiske uttalelser om jøder: Mehmet Görmez, som tidligere ledet den tyrkiske myndigheten for religiøse spørsmål, og den norske sosiologen Johan Galtung. SKMAs innlegg førte til at Gardell trakk seg fra arrangementet.
